В 2010 году в атмосфере Земли стали формироваться гигантские ураганы, которые стали причиной экологической катастрофы и гибели 5 миллиардов землян. Северная Америка, Россия и Европа пострадали от обледенения. Кое-как выживает южная часть ЕС и объединенные государства Азии. Японии повезло более прочих: новые технические разработки позволили ей наладить хоть относительную экономическую стабильность. Правда, имущественное расслоение общества стало очень жестким: Япония делится на «логосов» и «ревенусов», имущих и неимущих соответственно. За чертой города, в гетто ревенусов прячется от спецназа молодой человек с маленькой девочкой. Его преследуют очень упорно, следят со спутников, явно стараясь взять живым. Когда положение Дзина и Саны становится безнадежным, в операцию по поимке беглецов неожиданно вмешивается человек в сверхсовременном доспехе. Спецназ перебит, и, к изумлению Саны, Дзин благодарит спасителя, называя его по имени...

В 2131 году человечество агонизировало после серии разрушительных мировых войн. Оазисом в мире хаоса и смерти стал супер-город Олимпус, сумевший с помощью мощной армии защититься от врагов и обеспечить горожанам экономическое процветание. Достигнуто это было за счёт создания новой расы клонированных людей, названных биороидами. Это не простые клоны, а усовершенствованные люди с отборными генами и контролируемыми эмоциями. Биороиды составляют половину населения Олимпуса и благодаря высокому интеллекту контролируют большинство ключевых постов в городе. Это создаёт растущее недовольство людей, ситуация ухудшается с каждым днём. Профессиональная военная Дюнан Натс — свежеиспечённая гражданка Олимпуса, спасённая элитным отрядом ESWAT в бою за пределами города. В одном из бойцов ESWAT потрясённая девушка узнаёт свою прежнюю любовь — Бариариуса, которого считала умершим от ран. Как оказалось, его поставили на ноги, заменив основные органы электроникой и сделав из него киборга. Дюнан тоже становится бойцом ESWAT и постепенно привыкает к новой жизни. Но прибытие девушки в Олимпиус не прошло незамеченным — неизвестные покушаются на её жизнь. Это как-то связано с таинственным «Семенем яблока», к которому Дюнан, как выясняется, имеет прямое отношение...